医院始建于1958年，是一所具有近60年历史的精神专科医院，现占地面积约5.1万平方米，建筑面积约4.9万平方米，设南北两个院区，以打造园林式医院为特色。2008年8月仙岳医院与南山疗养院合并，正式成为闽西南地区规模最大的厦门市精神卫生中心，并先后成为厦门医学院非直属附属医院，厦门大学医学院教学医院，闽南师范大学心理学研究生教育创新基地，济宁医学院、福建医科大学、福建中医药大学、福建泉州医高专等高校的实践教学基地，中国厦门—加拿大精神卫生教育与科研合作中心、国家精神心理疾病临床医学研究中心北大六院厦门分中心、国家精神心理疾病临床医学研究中心网络成员单位，兰州市第三人民医院（兰州市精神卫生中心）共建医院，晋江疗养院为协作医院，国家精神科住院医师规范化培训基地等，是厦门市“红十字”医院。2010年成为国家“686”项目地区，2014年被推荐成为福建省国家精神卫生综合管理示范区。历经50余载仙岳人的拼搏进取，医院已发展成为闽南地区唯一一所集医疗、教学、科研、预防保健于一体的三级甲等精神专科医院，承担着厦门地区及周边省市精神卫生医疗、防治、教学和科研等任务。

   医院有职工823人，其中专业技术人员652人，正高20人，副高61人，中级职称181人，本科352人，硕士79人，博士4人。编制床位数900张，实际开放1500余张。设有精神科、心理科、中西医结合精神科、儿童青少年科、老年精神科、强制医疗、物质依赖等二十个病区和急性醉酒治疗室、儿童心理艺术治疗室、精神卫生研究室、精神卫生产学研联合实验室、精神医学鉴定机构及内外妇科、口腔科、体检部等。

医院现拥有西门子核磁共振机、64 排螺旋CT、数字化摄影系统（DR）、心理CT、脑功能诊断治疗仪、经颅多普勒、脑诱发电位仪、睡眠治疗仪、经颅磁疗仪、超级脑电分析仪、无抽搐电疗仪、彩色B超、全自动生化分析仪、血药浓度分析仪、高效液相、气相色谱仪、遗传基因检测仪等先进医疗设备，较好地为临床科研工作提供准确、科学、全面的信息和数据，有效推动科研工作和精神学科的发展。

   近年来，获得福建省科技厅项目3项、省卫生计生项目10项、厦门市科技局项目10项、市卫计委项目5项、实用型发明专利2项、省医学会医学科技三等奖，在国内外医学杂志上发表医学论文共300余篇，共有SCI论文7篇（3篇综述、4篇论著），影响因子10.7。平均每年申报国家级继续医学教育项目约5项，省市级继续医学教育项目约10项。